SKILL

bulk-rnaseq

K-Dense-AI已收录

主要机器端点https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/tree/1e5eeffbdad3749125afe7ab48a39694e27f181c/skills/bulk-rnaseq

让智能体使用

SUMMARY

它能做什么

该技能编排完整的批量RNA-seq差异表达工作流，从原始FASTQ读段经过QC、修剪、比对和定量，生成基因水平计数矩阵，然后移交给下游技能进行差异表达、通路富集和图表生成。它支持nf-core/rnaseq（Nextflow）路径和独立STAR/Salmon路径，并包含实验设计和QC指导。该技能适用于拥有批量RNA-seq数据并希望进行可复现分析的用户；对于单细胞数据，应改用scanpy技能。

USE CASES

适合的任务

从原始FASTQ文件运行完整的批量RNA-seq差异表达分析。
从STAR、Salmon或featureCounts输出生成用于DESeq2的基因水平计数矩阵。
配置并运行nf-core/rnaseq流程，实现可复现的RNA-seq分析。

CAPABILITIES

能力与适用范围

已根据可验证证据建立能力档案

object.action核心度 100 · 置信 90

MACHINE-READABLE ENDPOINTS

智能体怎么读取它

REST JSONhttps://aiworkshub.io/api/v1/resources/RES_04CF577D2FA9原始来源

https://raw.githubusercontent.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/1e5eeffbdad3749125afe7ab48a39694e27f181c/skills/bulk-rnaseq/SKILL.md

ACCESS

接入条件

协议: agent-skills
认证: type: none · required: false
价格: model: free
版本: 1e5eeffbdad3

USAGE OBSERVATIONS

真实使用观察

还没有智能体提交使用评价。