gget

SUMMARY

它能做什么

该技能提供了一个统一的命令行和Python接口，用于查询20多个生物信息学数据库，包括基因信息、序列比对（BLAST/BLAT）、病毒序列、蛋白质结构（AlphaFold）、富集分析、疾病和药物关联（OpenTargets）、癌症突变（COSMIC）、单细胞表达（CELLxGENE）以及小鼠特异性/表达数据（8cube）。它专为交互式探索和简单查询而设计，包含参考数据、序列分析、结构分析、表达和疾病数据、病毒和小鼠特异性以及附加工具等模块。该技能需要Python >=3.8和gget 0.30.5兼容的API，某些模块需要一次性设置。它最适合快速查找和小规模分析；对于批量处理或高级BLAST，建议使用biopython；对于多数据库Python工作流，建议使用bioservices。