primekg

SUMMARY

它能做什么

该技能提供对精准医学知识图谱（PrimeKG）的程序化访问，支持搜索实体（基因、药物、疾病、表型）、检索直接邻居和关联、分析疾病背景以及识别药物-疾病路径。它专为基于知识的药物发现、药物再利用、表型分析和网络药理学而设计。该技能包含一个Python脚本（query_primekg.py），用于查询从PrimeKG哈佛Dataverse下载的本地CSV数据文件（kg.csv）。源文档描述了诸如search_nodes、get_neighbors和get_disease_context等函数，并列出了关系类型，包括protein_protein、drug_protein、disease_gene、drug_disease、disease_phenotype和gwas。该技能是K-Dense的Scientific Agent Skills库的一部分，并采用MIT许可证。