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One-Page Readiness Check — 10 Signals, Arabic or English一页就绪检查——10个信号，阿拉伯语或英语MCP 服务mcp端点可用
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latchbio-integration使用 Python SDK、CLI、Latch Data 和 Registry、Nextflow、Snakemake、程序化执行以及 Latch MCP 在 Latch 上构建、注册、调试和操作生物信息学工作流。在编写或部署 Latch 工作流、配置资源或界面、移动数据、集成 Registry 或启动和监控运行时使用。技能agent-skills已收录
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spark-memory-thermal-ops管理NVIDIA DGX Spark上长时间运行的ML作业的统一内存和热状态。在规划GB10训练运行的内存余量、作业在统一内存上OOM、或监控数小时训练期间的温度和功率时使用。技能agent-skills已收录
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zarr-python用于云存储的分块N维数组（Zarr-Python 3）。压缩数组、并行I/O、通过fsspec访问S3/GCS，兼容NumPy/Dask/Xarray，适用于大规模科学计算流水线。技能agent-skills已收录
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screen-reader-testing使用屏幕阅读器（包括 VoiceOver、NVDA 和 JAWS）测试 Web 应用程序。在验证屏幕阅读器兼容性、调试可访问性问题或确保辅助技术支持时使用。技能agent-skills已收录
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bids在处理脑成像数据结构（BIDS）数据集时使用此技能：组织神经科学和生物医学数据（MRI、EEG、MEG、iEEG、PET、显微镜、NIRS、运动捕捉、EMG、MR波谱、行为学），查询BIDS布局，验证合规性，将DICOM转换为BIDS，编写元数据sidecar，或创建BIDS衍生数据。技能agent-skills已收录
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genomic-coordinates在基因组坐标约定之间转换区间，规范并比较变异表示，并在它们破坏分析之前检测组装或重叠群命名不匹配。每当坐标跨越格式、工具或组装边界时使用——在BED、GFF/GTF、VCF、SAM/BAM、WIG、PSL、genePred、Picard interval_list或区域字符串之间转换；协调0-based半开与1-based闭区间；左对齐或修剪插入缺失；检查两个变异记录是否描述相同的变化；将基因组位置映射到转录本、CDS或蛋白质位置；审计BED/GTF/VCF是否符合约定；或诊断GRCh37与hg19与GRCh38与T2T、chr前缀和liftover问题。触发词包括"off by one"、"0-based"、"1-based"、"half-open"、"coordinate system"、"left-align"、"normalize variant"、"bcftools norm"、"chr prefix"、"wrong genome build"、"liftover"、"REF mismatch"和"HGVS"。技能agent-skills已收录
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autoskill通过 screenpipe 观察用户的屏幕，检测重复的研究工作流，将其与现有的 scientific-agent-skills 进行匹配，并为尚未覆盖的模式起草新技能（或组合现有技能的编排配方）。当用户要求分析其近期工作并根据实际行为提出技能建议时使用。需要本地运行 screenpipe 守护进程（https://github.com/screenpipe/screenpipe）并监听 3030 端口——该技能没有其他数据源，如果 screenpipe 不可达将拒绝运行。所有检测均在本地进行；只有经过脱敏处理的聚类摘要才会发送给 LLM。技能agent-skills已收录
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iso-standards-readiness准备并结构化审查ISO管理体系与实验室能力标准的就绪证据——ISO 13485医疗器械质量管理体系、ISO 14971器械风险管理、ISO/IEC 17025检测和校准实验室、ISO 15189医学实验室。用于组织声明范围、受控文件、风险管理文件、认可范围、可追溯性、CAPA、外部供应商控制或受限本地证据清单，并区分ISO认证与实验室认可、FDA QMSR检查、CLIA认证、MDSAP和EU MDR/IVDR证据边界。不用于法律适用性、合规性、认证或认可决定；不含条款文本。技能agent-skills已收录
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pathml使用 PathML 进行本地、仅限研究的计算病理学工作流：加载和切片幻灯片，构建预处理和质控流程，管理 h5path 数据，量化多重免疫组化图像，构建空间图，并规划有界模型推理。技能agent-skills已收录
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aeon此技能应用于时间序列机器学习任务，包括分类、回归、聚类、预测、异常检测、分割和相似性搜索。当处理时间数据、序列模式或需要超越标准机器学习方法的专门算法的时间索引观测时使用。特别适用于单变量和多变量时间序列分析，并提供与scikit-learn兼容的API。技能agent-skills已收录
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nft-standards实现NFT标准（ERC-721、ERC-1155），包括正确的元数据处理、铸造策略和市场集成。在创建NFT合约、构建NFT市场或实现数字资产系统时使用。技能agent-skills已收录
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pptx-posters创建并审计可编辑的科学海报，使用无宏的PowerPoint（.pptx）格式，基于作者批准的本地内容和资源。当请求的交付物是PowerPoint研究/会议海报，并且需要精确的物理、打印机、可访问性、来源和包安全检查时使用。技能agent-skills已收录
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timesfm-forecasting使用Google的TimesFM基础模型进行零样本时间序列预测。适用于任何单变量时间序列（销售、传感器、能源、生命体征、天气），无需训练自定义模型。支持CSV/DataFrame/数组输入，提供点预测和预测区间。包含预检系统检查脚本，首次使用前验证RAM/GPU。技能agent-skills已收录
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uncertainty-and-units使用 pint 和 uncertainties 跟踪物理单位并在科学计算中传播测量不确定度。用于单位转换和量纲检查、GUM 不确定度预算、A 类和 B 类评定、包含因子和扩展不确定度、蒙特卡洛传播、有效数字和正负号报告、通过曲线拟合的误差传播、CODATA 常数、审计 Python 代码中剥离单位或破坏不确定度传播的问题，以及使用无量纲数群（雷诺数、佩克莱数、达姆科勒数、克努森数、毕奥数、沃默斯利数）、特征尺度（如扩散时间或德拜长度）和观测数量级范围进行数量级合理性检查。触发条件为“这个数字物理上合理吗”、“检查这些单位”、“这个流动处于什么状态”，或结果偏离数量级。技能agent-skills已收录
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waypoint-bio当使用Outpost Bio的开源微生物组基础模型时使用——Waypoint检查点（Waypoint-6m、Waypoint-45m、Waypoint-170m）、Atlas预训练语料库、Compass八任务基准，或来自`waypoint-bio`包的`waypoint` CLI。涵盖嵌入微生物组样本、在分类丰度数据上微调、在Compass上对检查点进行基准测试、在分类丰度配置文件上预训练GPT-2模型，以及将MetaPhlAn、Kraken2、QIIME 2或MGnify丰度表转换为waypoint格式。技能agent-skills已收录
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openpiv使用 OpenPIV 进行粒子图像测速（PIV）分析。当需要从 PIV 图像对中提取速度场、分析流体动力学或流动可视化实验、对 interrogation window 进行互相关、验证和替换错误的 PIV 矢量，或从测量的速度场计算涡量、应变率和湍流统计量时使用。技能agent-skills已收录
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scikit-learn使用 scikit-learn 在 Python 中进行机器学习。适用于监督学习（分类、回归）、无监督学习（聚类、降维）、模型评估、超参数调优、预处理或构建机器学习流水线。提供算法、预处理技术、流水线和最佳实践的全面参考文档。技能agent-skills已收录
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cqrs-implementation实现命令查询职责分离（CQRS）以构建可扩展架构。适用于分离读写模型、优化查询性能或构建事件溯源系统时使用。技能agent-skills已收录
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markdown-mermaid-writing全面的 Markdown 和 Mermaid 图表编写技能。在创建任何科学文档、报告、分析或可视化时使用。将基于文本的图表确立为默认文档标准，包含完整样式指南（Markdown + Mermaid）、24 种图表类型参考和 9 种文档模板。技能agent-skills已收录
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neurokit2使用 NeuroKit2 构建或审计可复现的生理时间序列预处理、事件/区间分析、多模态对齐、变异性和复杂性研究流程。当代码导入 neurokit2 或需要其当前 API、模式和方法感知验证时触发——不用于诊断或设备验证。技能agent-skills已收录
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git-workflow-and-versioning结构化 git 工作流实践。在进行任何代码更改时使用。在提交、分支、解决冲突、打开或审查拉取请求（PR）、推送到远程，或需要跨多个并行流组织工作时使用。在发布版本、选择语义化版本号、打标签或编写变更日志时使用。技能agent-skills已收录
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gtars使用Gtars进行局部基因组区间模型和集合代数、重叠与计数、共识与覆盖度、分词、片段处理，以及跨Python、Rust和CLI的refget/BEDbase规划。技能agent-skills已收录
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pytdc通过PyTDC Python包使用Therapeutics Data Commons，用于注册表发现、已批准数据集访问、任务感知分割、评估指标、基准组和有界分子预言机工作流。技能agent-skills已收录
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benchling-integrationBenchling Python SDK 和 REST API 集成，用于注册表实体、库存、ELN 条目、工作流、Benchling Apps 和数据仓库查询。在自动化实验室数据时使用 benchling-sdk 或 v2 API。技能agent-skills已收录
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scientific-visualization创建并审计真实、可访问、可发表的科学图表，使用 Matplotlib、Seaborn 或 Plotly。用于图形设计、多面板布局、不确定性和缺失数据展示、颜色/对比度审查、图像元数据验证以及期刊导出规划。技能agent-skills已收录
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torch-geometricPyTorch Geometric (PyG) 用于图神经网络——节点/边/图分类、消息传递（GCN、GAT、GraphSAGE、GIN）、异构图、邻居采样和自定义数据集。当使用 torch_geometric 时使用，不适用于一般的 NetworkX 分析或非图 PyTorch 模型。技能agent-skills已收录
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stable-baselines3生产就绪的强化学习算法（PPO、SAC、DQN、TD3、DDPG、A2C），具有类似 scikit-learn 的 API。用于标准 RL 实验、快速原型设计和文档完善的算法实现。最适合使用 Gymnasium 环境的单智能体 RL。对于高性能并行训练、多智能体系统或自定义向量化环境，请改用 pufferlib。技能agent-skills已收录
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pkpd-modeling药代动力学和药效学建模与模拟——非房室分析、房室和群体PK、PK/PD和暴露-反应、TMDD、PBPK方向、生物等效性、异速缩放和首次人体剂量、药物相互作用预测以及贝叶斯治疗药物监测。当分析浓度-时间数据、推导暴露指标、拟合PK或PD模型或评估给药方案时使用。触发词包括“药代动力学”、“药效学”、“PK/PD”、“NCA”、“非房室”、“AUC”、“Cmax”、“lambda z”、“半衰期”、“清除率”、“分布容积”、“房室模型”、“群体PK”、“popPK”、“NONMEM”、“nlmixr2”、“Pharmpy”、“Monolix”、“暴露-反应”、“Emax”、“EC50”、“间接反应”、“效应室”、“TMDD”、“PBPK”、“生物等效性”、“RSABE”、“ABEL”、“异速缩放”、“首次人体”、“MABEL”、“药物-药物相互作用”、“DDI”、“ICH M12”、“浓度-QTc”、“治疗药物监测”、“MIPD”和“给药方案”。技能agent-skills已收录
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hugging-science当用户在生物学、化学、物理学、天文学、气候学、基因组学、材料科学、医学、生态学、能源、工程学、数学、药物发现、蛋白质设计、天气建模、定理证明、单细胞或偏微分方程求解等科学领域进行AI/ML工作时使用。Hugging Science是一个精选的科学数据集、模型、博客文章和交互式Spaces目录。此技能有助于通过`datasets`、`transformers`、HF推理API、`gradio_client`和方法论引用发现和使用资源。技能agent-skills已收录
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torchdrug构建并排查 TorchDrug 0.2.1 工作流，涵盖分子图、性质预测、自监督预训练、分子生成、逆合成、蛋白质表示学习和知识图谱推理。当代码导入 torchdrug 或需要其数据集、模型、任务或 Engine 时使用。技能agent-skills已收录
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pi-agent使用 Pi 构建和使用，Pi 是一个极简的终端编码工具。用于安装 Pi、配置提供商/模型/设置/环境变量、创建 Pi 技能/扩展/包/主题/提示模板、通过 SDK 嵌入 Pi、通过 RPC 或 JSON 事件流集成、解析会话、通过 llama.cpp 路由器运行本地模型、开发自定义 Pi 提供商和 TUI 组件，或使用生态系统包，如 pi-subagents（委派/编排）、pi-mcp-adapter（MCP 服务器）、pi-interview（交互式表单）和 pi-web-access（网络搜索、抓取、视频理解）。技能agent-skills已收录
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arbor自主改进真实工件（代码、训练配方、智能体框架、数据管道、提示词），以目标和评估器为依据，使用 Arbor 论文中的假设树细化（HTR）。当用户希望在多次实验中迭代优化某物而不过拟合时使用——例如“提高我的模型评估分数”、“改进这个智能体/框架”、“调整这条管道”、“在此基准上击败基线”、“运行搜索并保留最佳方案”、“进行 MLE-bench / Kaggle 式优化”，或任何长期“让这个工件更好，不要只记住开发集”的任务。即使没有提到“Arbor”或“假设树”，只要描述了重复实验-评估循环、竞争想法的分支探索或担心开发/测试差距，也应触发。以 Claude 自身为协调者，在隔离的 git worktree 中运行子代理执行器；独立 `arbor` CLI 工具见 references/arbor-upstream.md。技能agent-skills已收录
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brand-landingpage品牌优先的着陆页设计器——通过品牌身份访谈（颜色、字体、形状语言），然后通过 Stitch 生成并迭代精美的着陆页，并提供可直接部署的 HTML。当用户要求创建、设计或构建着陆页、主页或营销页面且没有既定的视觉方向时使用。当用户有设计稿、需要仪表盘或应用 UI、在组件级别工作、构建多页面应用或使用已知设计令牌进行重新样式时跳过——改用 frontend-design。技能agent-skills已收录
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pyopenms完整的质谱分析平台。用于蛋白质组学和代谢组学工作流程——特征检测、肽段/蛋白质鉴定、无标记和等压定量、加合物/精确质量注释以及复杂的LC-MS/MS流程。支持多种文件格式和算法。对于简单的谱图比较和小分子库匹配，请使用matchms。技能agent-skills已收录
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etetoolkit使用ETE 4分析、操作、比较、注释和可视化系统发育或其他层次树。用于Newick/Nexus树的输入输出、拓扑编辑和模式匹配、Robinson-Foulds比较、基因树进化事件和协调、NCBI/GTDB分类学、SmartView探索和出版渲染。不要用它从原始序列推断树；先比对序列并推断树。技能agent-skills已收录
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geniml使用 Geniml 进行经审计的本地基因组区间工作流：验证 BED 和 universe 契约，规划 Region2Vec 或 scEmbed 运行，检查模型/分词器兼容性，并评估共识 universe。技能agent-skills已收录
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glycoengineering分析和工程化蛋白质糖基化。扫描序列中的N-糖基化序列基序（N-X-S/T），预测O-糖基化热点，并访问精选的糖工程工具（NetOGlyc、GlycoShield、GlycoWorkbench）。适用于糖蛋白工程、治疗性抗体优化和疫苗设计。技能agent-skills已收录
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