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physics-lab-plotter将物理实验数据从照片、截图或文件转换为带检查的表格和Origin风格拟合曲线,并生成LaTeX PDF报告。技能agent-skills已收录
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experimental-design在数据收集前设计实验和研究:选择设计、随机化、区组、处理组合;涵盖因子、响应面、交叉、裂区等设计。技能agent-skills已收录
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pacsomatic用于 nf-core/pacsomatic 匹配肿瘤-正常流程的操作工具包:验证输入、生成样本表、准备 Nextflow 启动工件、本地或调度器运行以及故障排查。技能agent-skills已收录
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cellxgene-census查询CZ CELLxGENE Census获取版本化的公共单细胞和空间转录组数据,包括元数据、表达和嵌入。技能agent-skills已收录
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diffdockDiffDock分子对接技能:从PDB/序列和SMILES/SDF/MOL2预测蛋白质-小分子构象,支持批量对接、虚拟筛选和构象置信度解释。技能agent-skills已收录
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statsmodels提供Python统计模型(OLS、GLM、混合模型、ARIMA)及诊断、残差和推断,适用于计量经济学和时间序列。技能agent-skills已收录
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hydrological-modeller作为水文建模专家,在 SAPPHIRE 内开发、维护和审查预测模型,包括代码文档和科学有效性检查。技能agent-skills已收录
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labarchive-integration安全集成LabArchives ELN和Inventory API v1的技能,包括签名请求和授权流程。技能agent-skills已收录
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bio-microbiome-functional-prediction使用PICRUSt2从16S rRNA数据预测宏基因组功能,推断KEGG、MetaCyc和EC丰度。技能agent-skills已收录
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genomic-intelligence通过REST API使用托管transformer模型从DNA预测调控特征、基因结构和表达,涵盖六种任务。技能agent-skills已收录
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nemo-mbridge-perf-moe-hardware-configs按硬件平台和模型系列总结MoE训练手册,包括吞吐量范围和并行模式。技能agent-skills已收录
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phylogenetics使用MAFFT、IQ-TREE 2和FastTree构建和分析系统发育树,并用ETE3或FigTree可视化。技能agent-skills已收录
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pysam提供pysam工作流,用于读写和查询SAM/BAM/CRAM、VCF/BCF、FASTA/FASTQ等基因组文件,支持pileup、覆盖度、索引和CRAM参考。技能agent-skills已收录
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design-experiment协作设计 GPU 实验为数据收集规范,记录目的、分组、指标、可比性和成本,然后移交给 launch-experiment。技能agent-skills已收录
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protocolsio-integration使用官方 REST/MCP 契约读取、验证和安全导出 protocols.io 数据,仅在显式 --execute 时进行受限 GET 请求;创建不执行的变更计划。技能agent-skills已收录
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scikit-survival使用scikit-survival构建、评估和审计右删失或竞争风险生存工作流的技能,包括防泄漏预处理、模型选择、概率预测和考虑删失的指标。技能agent-skills已收录
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pathogen-variant-surveillance通过GenSpectrum LAPIS API查询实时病原体基因组监测数据,了解流行谱系、增长和突变。技能agent-skills已收录
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cobrapy执行基于约束的代谢建模(COBRA),包括FBA、FVA、基因敲除、通量采样和SBML模型处理,用于系统生物学和代谢工程分析。技能agent-skills已收录
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pathway-enrichment对基因列表或排序数据进行通路和基因集富集分析,包括 ORA、GSEA、ssGSEA 及使用多种工具和数据库的功能分析。技能agent-skills已收录
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New Research Papers & Science Breakthroughs — buy per-query in-session (scibreak)提供来自arXiv的AI、物理和生物领域每日新研究论文。MCP 服务mcp已收录
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