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physics-lab-plotter将物理实验数据从照片、截图或文件转换为带检查的表格和Origin风格拟合曲线,并生成LaTeX PDF报告。技能agent-skills
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experimental-design在数据收集前设计实验和研究:选择设计、随机化、区组、处理组合;涵盖因子、响应面、交叉、裂区等设计。技能agent-skills
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scientific-schematics使用Nano Banana 2 AI创建出版级科学图表,具备迭代优化和质量审查。技能agent-skills
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pacsomatic用于 nf-core/pacsomatic 匹配肿瘤-正常流程的操作工具包:验证输入、生成样本表、准备 Nextflow 启动工件、本地或调度器运行以及故障排查。技能agent-skills
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TARGET Checklist MCP评估目标试验模拟研究报告符合TARGET指南要求的完整程度。MCP 服务mcp
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brenda-database通过SOAP API访问BRENDA酶数据库,检索动力学参数、反应、生物体数据及底物特异性酶信息。技能agent-skills
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proof-checker验证并修复LaTeX数学证明,通过交叉模型审查找出漏洞并生成审计报告。技能agent-skills
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cellxgene-census查询CZ CELLxGENE Census获取版本化的公共单细胞和空间转录组数据,包括元数据、表达和嵌入。技能agent-skills
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matchms使用matchms处理、清理、比较和搜索串联质谱数据。技能agent-skills
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diffdockDiffDock分子对接技能:从PDB/序列和SMILES/SDF/MOL2预测蛋白质-小分子构象,支持批量对接、虚拟筛选和构象置信度解释。技能agent-skills
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statsmodels提供Python统计模型(OLS、GLM、混合模型、ARIMA)及诊断、残差和推断,适用于计量经济学和时间序列。技能agent-skills
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sympyPython精确符号数学技能:代数、微积分、方程求解、符号线性代数及通过lambdify/LaTeX生成代码。技能agent-skills
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depmap查询癌症依赖图谱,获取基因依赖得分、药物敏感性和基因效应谱,以识别癌症弱点并验证药物靶点。技能agent-skills
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hydrological-modeller作为水文建模专家,在 SAPPHIRE 内开发、维护和审查预测模型,包括代码文档和科学有效性检查。技能agent-skills
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imaging-data-commons查询和下载NCI影像数据共享中心的公共癌症影像数据,包括DICOM访问和元数据查询。技能agent-skills
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swarm-safety模拟多智能体动态,评估系统风险,测试治理并研究涌现行为。技能agent-skills
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geomaster全面的地理空间技能,支持遥感、GIS、空间分析和地球观测数据处理。技能agent-skills
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labarchive-integration安全集成LabArchives ELN和Inventory API v1的技能,包括签名请求和授权流程。技能agent-skills
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RFix根据提示创建射频信号项目,检查图形并导出IQ数据。MCP 服务mcp
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deepchem提供分子机器学习,具有多种特征化器和预构建数据集,用于传统ML或GNN的属性预测(ADMET、毒性)。技能agent-skills
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bio-microbiome-functional-prediction使用PICRUSt2从16S rRNA数据预测宏基因组功能,推断KEGG、MetaCyc和EC丰度。技能agent-skills
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genomic-intelligence通过REST API使用托管transformer模型从DNA预测调控特征、基因结构和表达,涵盖六种任务。技能agent-skills
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nemo-mbridge-perf-moe-hardware-configs按硬件平台和模型系列总结MoE训练手册,包括吞吐量范围和并行模式。技能agent-skills
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phylogenetics使用MAFFT、IQ-TREE 2和FastTree构建和分析系统发育树,并用ETE3或FigTree可视化。技能agent-skills
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CycleCalcs Astronomy提供太阳、月亮、行星、日食月食、晨昏蒙影和恒星位置等天文计算。MCP 服务mcp
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pysam提供pysam工作流,用于读写和查询SAM/BAM/CRAM、VCF/BCF、FASTA/FASTQ等基因组文件,支持pileup、覆盖度、索引和CRAM参考。技能agent-skills
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design-experiment协作设计 GPU 实验为数据收集规范,记录目的、分组、指标、可比性和成本,然后移交给 launch-experiment。技能agent-skills
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protocolsio-integration使用官方 REST/MCP 契约读取、验证和安全导出 protocols.io 数据,仅在显式 --execute 时进行受限 GET 请求;创建不执行的变更计划。技能agent-skills
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primekg查询精准医学知识图谱(PrimeKG),获取基因、药物、疾病、表型等多尺度生物数据。技能agent-skills
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molfeat用于机器学习的分子特征化,包含100多种特征化器,如ECFP、MACCS、描述符和ChemBERTa等预训练模型。技能agent-skills
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statistical-analysis指导研究数据的统计分析:测试选择、假设检验、效应量、功效分析、贝叶斯替代和APA报告。技能agent-skills
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Claidex MCP生物医学失败情报平台,用于终止试验和转化分析。MCP 服务mcp
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scikit-survival使用scikit-survival构建、评估和审计右删失或竞争风险生存工作流的技能,包括防泄漏预处理、模型选择、概率预测和考虑删失的指标。技能agent-skills
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pymc支持使用PyMC进行贝叶斯建模,包括层次模型、MCMC (NUTS)、变分推断、模型比较和后验检查。技能agent-skills
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pathogen-variant-surveillance通过GenSpectrum LAPIS API查询实时病原体基因组监测数据,了解流行谱系、增长和突变。技能agent-skills
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cobrapy执行基于约束的代谢建模(COBRA),包括FBA、FVA、基因敲除、通量采样和SBML模型处理,用于系统生物学和代谢工程分析。技能agent-skills
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qiskit使用Qiskit和IBM Quantum Runtime构建、模拟、转译和执行量子电路。技能agent-skills
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pathway-enrichment对基因列表或排序数据进行通路和基因集富集分析,包括 ORA、GSEA、ssGSEA 及使用多种工具和数据库的功能分析。技能agent-skills
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anndata用于处理单细胞分析中带注释矩阵的 AnnData 数据结构,包括 .h5ad 文件和 scverse 生态集成。技能agent-skills
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pufferlibPufferLib强化学习环境、向量化、策略、训练、评估及安全检查点审查的版本感知指南。技能agent-skills
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quantum-artificer为AI代理提供科学计算,包括符号、数值、量子、化学和ODE,通过x402付费。MCP 服务mcp
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histolab轻量级WSI切片提取和预处理:组织检测、切片提取、H&E图像染色归一化。技能agent-skills
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fluidsim用于规划、配置、检查、重启和分析有界FluidSim CFD模拟的技能,包含数值有效性和HPC安全检查。技能agent-skills
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Chiplab在虚拟硬件上运行、构建和验证固件,并提供硬件知识库。MCP 服务mcp
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lamindb用于 LaminDB 的技能,涵盖设置、工件注册、查询、谱系、验证、本体注释、集合、分支、存储和工作流。技能agent-skills
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src-sim-skill用于处理确定性移动、装甲、弹道、伤害和侦察模拟的技能,可能用于坦克游戏或模拟。技能agent-skills
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coot-NCS-reference-guidance提供晶体学中NCS(非晶体学对称)参考的指导。技能agent-skills
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New Research Papers & Science Breakthroughs — buy per-query in-session (scibreak)提供来自arXiv的AI、物理和生物领域每日新研究论文。MCP 服务mcp
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DAG Studio MCP因果DAG分析工具,用于后门路径、调整集和偏差模拟。MCP 服务mcp
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DaedalMap Tsunami Data提供NOAA NCEI全球海啸事件数据(公元前2000年至今),包括波高、爬高和次数。MCP 服务mcp
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